中山眼科中心是中山大学附属单位之一，她的前身是岭南大学医学院、中山大学医学院、光华医学院的眼科组成的中山医学院眼科教研室，组建于1953年。现有317张。
1983年，经国家卫生部批准，眼科医院被更名为“中山医科大学中山眼科中心”，副厅级建制。2001年10月，中山医科大学与中山大学合并，中山医科大学中山眼科中心更名为中山大学中山眼科中心。中山眼科中心下设眼科医院、眼科研究所、防盲治盲办公室和眼科视光学系，是集眼科医疗、科研、教学、保健和防盲治盲为一体的现代化多功能眼科中心，以规模大、专业人员多、专业齐全、整体学术水平高、仪器设备先进著称。
经过全体工作人员40多年的勤奋工作、开拓进取和无私奉献，在医疗、教学、科研和防盲方面取得了显著的成就。1989年，中山医科大学中山眼科中心的眼科学被国家教委审核批准为全国眼科学重点学科点。
1990年，卫生部批准在中山眼科中心内成立卫生部眼科学实验室。1995年，眼科医院通过三级甲等医院的评选，成为国内首家眼科三级甲等医院。
1995年眼科医院被广东省委、省府评为广东省文明单位。1997年，中山医科大学创办的眼科视光学系设在中山眼科中心。1998年，眼科医院被广东省卫生厅评为“百家文明医院”。2000年中山眼科中心被评为“全国卫生系统先进集体”和广东省“白求恩式先进集体”。
2001年，经教育部、广东省科技厅和教育厅批准成立了相应的眼科重点实验室；科技部－广东省科技厅共建眼科实验室。2001年中心被评为“广东省行风建设先进单位”。
2003年中心被广东省委、省政府授予“广东省先进集体”；2004年，部省共建国家重点实验室培育基地－广东省眼科视觉科学重点实验室通过验收，被评为优秀。
2005年，中山眼科中心眼科学实验室正式列入科技部2005年度眼科学国家重点实验室建设计划。2006年，眼科学国家重点实验室正式通过建设论证。
中心现有在编人员377人，其中专业人员321人，正副高级职称人员101人、中级职称人员138人，获博士学位55人、硕士学位41人，是一支人才梯队合理，人数和技术力量居国内先进行列的眼科专业队伍。其中135人从事眼科医疗、教学和科研工作。
中心眼科专业齐全，中心属下的眼科医院有12个专业科室（角膜并青光眼、眼底外科、白内障、眼肿瘤和眼眶并眼底内科、眼整形、眼外伤、眼肌屈光、中医眼科、神经眼科、准分子激光）和12个辅助科室；眼科研究所有11个专业实验室（病理、眼眶病与眼肿瘤、生化、白内障、遗传分子生物学、视觉科学、视觉生理、玻璃体视网膜并免疫、药理、眼库）。
设黄斑并小儿遗传眼并葡萄膜炎并隐形眼镜等临床专科；眼科视光学系设有5个实验室（应用光学实验室、隐形眼镜实验室、眼镜光学实验室、近视眼实验室、临床视光学实验室）；该中心属下还设有防盲治盲办公室。
角膜病专科被列为广东省“五个一科教兴医工程”重点专科、眼库与角膜移植实验室被列为广东省“五个一科教兴医工程”重点实验室。角膜病和白内障专科被列为广东省医学重点专科。
每个专科已形成了自己的医疗和科研特色。角膜移植、准分子激光角膜屈光矫正手术、角膜形态学、白内障的手术治疗、葡萄膜视网膜炎发病机制系列研究、青光眼和视网膜玻璃体疾病的诊治居国内领先地位，部分领域达国际先进水平。
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