牙垢、牙石和牙周组织病的关系非常密切。实验表明，在无菌状态下，单纯粗糙的牙石表面，对牙龈的机械刺激，并不引起牙龈明显的炎症。但长期积压的食物嵌塞，牙石对牙周组织的危害，主要在于它构成了菌斑附着，滋生的良好部位。此外，牙石的存在会妨碍口腔卫生，促使菌斑更多地形成。牙石本身也容易吸附更多的细菌毒素，对软组织造成刺激，使牙龈充血，水肿，刷牙时出血。 当牙龈炎症继续向深层组织发展，甚至会出现牙龈自发性出血倾向和口腔异味。伴随着牙槽骨的破坏，牙齿将松动、移位、咀嚼无力。 菌斑和牙石是牙周炎症的主要致病物，因此，在牙周组织疾病的预防和治疗中，彻底清除牙石是至关重要的。
牙菌斑是指粘附在牙齿表面或口腔其他软组织上的微生物群。它是由大量细菌、细胞间物质、少量白细胞、脱落上皮细胞和食物残屑等组成。不能用漱口或用水冲洗的方法把它去除。因此，现在把菌斑看成是细菌附着在牙石上的一种复杂的生态结构，其与龋病和牙周病的发生有密切的关系。
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